RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 PLAURQ03405 335 aa21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 HHATQ5VTY9 493 aa21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 SSX8Q7RTT4 187 aa21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA19Q7Z5L4 167 aa21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 PIGXQ8TBF5 258 aa21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 NEUROG1Q92886 237 aa21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 MUCL1Q96DR8 90 aa21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJA3Q96EY1 480 aa21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 ARL5BQ96KC2 179 aa21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 LIPT1Q9Y234 373 aa21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1W2PP18 115 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC154A6NI56 674 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 C1QCP02747 245 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 PGRP06401 933 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 SOD3P08294 240 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 GGT1P19440 569 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC74AQ0VAA2 488 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 SYPL1Q16563 259 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 TIMM23BQ5SRD1 257 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 CMIPQ8IY22 773 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 ANKFN1Q8N957 763 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 OR52E6Q96RD3 313 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB18Q99592 522 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 SLC38A1Q9H2H9 487 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 USF3Q68DE3 2245 aa21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 FN1P02751 2386 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 ABCA2Q9BZC7 2435 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 DPRXA6NFQ7 191 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF716A6NP11 495 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 OVOL3O00110 214 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 ADAM11O75078 769 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 CHRM4P08173 479 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 DANCRP0C864 163 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 PCSK6P29122 969 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 IL12AP29459 219 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 CDKN2CP42773 168 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 HTR3AP46098 478 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 IDH2P48735 452 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 CLK1P49759 484 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 FBXW9Q5XUX1 488 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 UBE2J2Q8N2K1 259 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 WDR60Q8WVS4 1066 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 APH1AQ96BI3 265 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 INPP5KQ9BT40 448 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM2Q9C040 744 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 OR11A1Q9GZK7 315 aa21.79■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 AGAP5A6NIR3 686 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 TRPC5OSA6NMA1 111 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 GPR171O14626 319 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 HDAC3O15379 428 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 IGHV3-9P01782 118 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 CCNA2P20248 432 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 EPHA3P29320 983 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 GNA13Q14344 377 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 ETFDHQ16134 617 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF621Q6ZSS3 439 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 P2RY8Q86VZ1 359 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 ADGRG3Q86Y34 549 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 THAP1Q9NVV9 213 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 GPR45Q9Y5Y3 372 aa21.78■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 OR5H1A6NKK0 313 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 AP3D1O14617 1153 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 RAD51DO75771 328 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 PGM3O95394 542 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 CDKN1AP38936 164 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEA8P43361 318 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 OR2B6P58173 313 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 PPP2R2BQ00005 443 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 VEZF1Q14119 521 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 CLEC12BQ2HXU8 276 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 DDIT4LQ96D03 193 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM181Q9P2C4 612 aa21.77■■□□□ 1.08
ALYREF-203ENST00000511412 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa21.76■■□□□ 1.07
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM120BA0PK00 339 aa21.76■■□□□ 1.07
ALYREF-203ENST00000511412 GSNP06396 782 aa21.76■■□□□ 1.07
ALYREF-203ENST00000511412 NR2F1P10589 423 aa21.76■■□□□ 1.07
ALYREF-203ENST00000511412 KITP10721 976 aa21.76■■□□□ 1.07
ALYREF-203ENST00000511412 UQCRBP14927 111 aa21.76■■□□□ 1.07
ALYREF-203ENST00000511412 IL7RP16871 459 aa21.76■■□□□ 1.07
ALYREF-203ENST00000511412 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ALYREF-203ENST00000511412 SLC16A1P53985 500 aa21.76■■□□□ 1.07
ALYREF-203ENST00000511412 CDH11P55287 796 aa21.76■■□□□ 1.07
ALYREF-203ENST00000511412 WDR4P57081 412 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ALYREF-203ENST00000511412 FAPQ12884 760 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms