RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PIGU	Q9H490	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SENP1	Q9P0U3	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ATR	Q13535	2644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368		C9JVG2	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368		H3BQF6	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OVOL3	O00110	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC28A1	O00337	649 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	RGS14	O43566	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FCMR	O60667	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NDUFS7	O75251	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	BPGM	P07738	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SOD3	P08294	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DANCR	P0C864	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	G6PD	P11413	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	COX5A	P20674	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KRT20	P35900	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PRKAG1	P54619	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HBA1	P69905	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	IL13RA1	P78552	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KEAP1	Q14145	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ACKR1	Q16570	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	BIVM	Q86UB2	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SFXN5	Q8TD22	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GPR151	Q8TDV0	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GPR119	Q8TDV5	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PERP	Q96FX8	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TEX37	Q96LM6	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368		Q96MF0	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	OR7D2	Q96RA2	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	STAC	Q99469	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PIF1	Q9H611	641 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A087WZY1	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	CLDN24	A6NM45	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	AP3D1	O14617	1153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	KIAA0513	O60268	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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