RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CBLN3	Q6UW01	205 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO27	Q8NI29	283 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF128	Q8TEB7	428 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM234	Q8WY98	164 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM19	Q96HH6	336 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF607	Q96SK3	696 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		15.45	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	AGAP5	A6NIR3	686 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFAB1	O14561	156 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	AIM2	O14862	343 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL13	O43927	109 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINB7	O75635	380 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	C1QC	P02747	245 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PGC	P20142	388 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC6A8	P48029	635 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CCR4	P51679	360 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP2K6	P52564	334 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNJ10	P78508	379 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FUT5	Q11128	374 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SKP2	Q13309	424 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	LIN52	Q52LA3	116 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SSX8	Q7RTT4	187 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINA11	Q86U17	422 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PIP5K1A	Q99755	562 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NANOG	Q9H9S0	305 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		15.44	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCA4	P78363	2273 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFSF11	O14788	317 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	EFNA2	O43921	213 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TMCC2	O75069	709 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ATE1	O95260	518 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ARAF	P10398	606 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ETS2	P15036	469 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FOSL1	P15407	271 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CPOX	P36551	454 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNJ5	P48544	419 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MTPN	P58546	118 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXF1	Q12946	379 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SCARB2	Q14108	478 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HIPK4	Q8NE63	616 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	NFKBID	Q8NI38	313 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	RCN3	Q96D15	328 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MED18	Q9BUE0	208 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		15.43	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKD3	O94806	890 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	PGM3	O95394	542 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	THBS1	P07996	1170 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MNAT1	P51948	309 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SIRPA	P78324	504 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KEAP1	Q14145	624 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	QPRT	Q15274	297 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK14	Q16539	360 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10A6	Q8NH74	314 aa		15.42	■□□□□ 0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF563	Q8TA94	476 aa		15.42	■□□□□ 0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms