RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 DPH7Q9BTV6 452 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 MEGF11A6BM72 1044 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SYPP08247 313 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 LY6KQ17RY6 165 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ALG10Q5BKT4 473 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF534Q76KX8 674 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 FCRLAQ7L513 359 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF596Q8TC21 504 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 UBE2FQ969M7 185 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 M0R082 166 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SLC10A3P09131 477 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 NME2P22392 152 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SLC19A1P41440 591 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ACY1Q03154 408 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF266Q14584 549 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 FAHD1Q6P587 224 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 GLRX5Q86SX6 157 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 HASPINQ8TF76 798 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 FAM46BQ96A09 425 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TREX1Q9NSU2 369 aa6.06□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 HTR1FP30939 366 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 GPR4P46093 362 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 HOXC5Q00444 222 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 POC1BQ8TC44 478 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 HGDQ93099 445 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 H3BRB1 525 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SERINC3Q13530 473 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ST3GAL2Q16842 350 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 RBP7Q96R05 134 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.05□□□□□ -1.44
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SBNO1-202ENST00000420886 SRMP19623 302 aa6.05□□□□□ -1.44
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SBNO1-202ENST00000420886 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 PRRC1Q96M27 445 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 DPEP1P16444 411 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 PTGFRP43088 359 aa6.05□□□□□ -1.44
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SBNO1-202ENST00000420886 MASP1P48740 699 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 PGGT1BP53609 377 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 BDH1Q02338 343 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 CAMK2DQ13557 499 aa6.05□□□□□ -1.44
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SBNO1-202ENST00000420886 NPY6RQ99463 290 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 NTMT1Q9BV86 223 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
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SBNO1-202ENST00000420886 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1B0GVT2 93 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SERPINA2P20848 420 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 KCNJ10P78508 379 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 GPR78Q96P69 363 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 SYT3Q9BQG1 590 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 PRO1933Q9H354 126 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 USP22Q9UPT9 525 aa6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1B0GTQ1 180 aa6.05□□□□□ -1.44
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