RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 OPRM1P35372 400 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 PLXDC2Q6UX71 529 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 NAXEQ8NCW5 288 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 OR52E4Q8NGH9 312 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 TAMM41Q96BW9 452 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 DDIT4LQ96D03 193 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 KCNJ16Q9NPI9 418 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 ADA2Q9NZK5 511 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 BAG5Q9UL15 447 aa24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF208O43345 1280 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 CLDN1O95832 211 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 CCNA2P20248 432 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 HOXC5Q00444 222 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 C16orf89Q6UX73 402 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 PGAM4Q8N0Y7 254 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 LSMEM1Q8N8F7 131 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 PROX1Q92786 737 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 NSL1Q96IY1 281 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF559Q9BR84 538 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 SFXN3Q9BWM7 321 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 SELENONQ9NZV5 590 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 IL18BPO95998 194 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 CRHP06850 196 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 BMP5P22003 454 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 KDELR2P33947 212 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF136P52737 540 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 RAC3P60763 192 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 RNF122Q9H9V4 155 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM27Q9HBJ8 222 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM181Q9P2C4 612 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa24.61■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 A0A1W2PNR3 127 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 FAM90A27PA6NNH2 459 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 FESP07332 822 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 HTR1EP28566 365 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 GSK3BP49841 420 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 TMPPEQ6ZT21 453 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 COMTD1Q86VU5 262 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 GCNT2Q8N0V5 402 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 COQ10BQ9H8M1 238 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 CHST11Q9NPF2 352 aa24.6■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 COL12A1Q99715 3063 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 PRSS44E7EML9 344 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 SULT2B1O00204 365 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 PLGP00747 810 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 CD247P20963 164 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 CALB2P22676 271 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 CDSNQ15517 529 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 MCEMP1Q8IX19 187 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 GPR32P1Q8NGA4 272 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 C3orf49Q96BT1 292 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGDIGQ99819 225 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 GLRX2Q9NS18 164 aa24.59■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM72A0PK05 275 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 FMO6PO60774 539 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 GMNNO75496 209 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 AQP8O94778 261 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 DIO1P49895 249 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 NRF1Q16656 503 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 LIX1LQ8IVB5 337 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 LZICQ8WZA0 190 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC46Q96FV0 321 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 UCK2Q9BZX2 261 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 OR11A1Q9GZK7 315 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 C12orf10Q9HB07 376 aa24.58■■□□□ 1.53
FAAP20-204ENST00000400919 CXCR6O00574 342 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 PNMTP11086 282 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 CRYBA2P53672 197 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 SLC25A3Q00325 362 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 FOXF2Q12947 444 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 MYBPHQ13203 477 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 CYBRD1Q53TN4 286 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 ULK3Q6PHR2 472 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 SLC43A2Q8N370 569 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 SRXN1Q9BYN0 137 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 ADPRHL2Q9NX46 363 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 TRAPPC4Q9Y296 219 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 SH3GLB1Q9Y371 365 aa24.57■■□□□ 1.52
FAAP20-204ENST00000400919 A0A1B0GWA3 101 aa24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms