RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 MSRAQ9UJ68 235 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHA2P01877 340 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 LIMS3P0CW19 117 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 LIMS4P0CW20 117 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 AQP2P41181 271 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 Q6ZSR6 202 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 GPAT4Q86UL3 456 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 RDH10Q8IZV5 341 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR5J2Q8NH18 312 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 TEAD3Q99594 435 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 NOX4Q9NPH5 578 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SDK2Q58EX2 2172 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SELENOFO60613 162 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 LALBAP00709 142 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 TCRBP04435 133 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 F3P13726 295 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CPEP16870 476 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 GDNFP39905 211 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CRYBA2P53672 197 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ACTC1P68032 377 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ACTA1P68133 377 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR18Q14330 331 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SYNPRQ8TBG9 265 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR1E3Q8WZA6 343 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 DVL2O14641 736 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ICMTO60725 284 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 HTR1FP30939 366 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 DDOSTP39656 456 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ARHGDIBP52566 201 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 MVDP53602 400 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 GRM7Q14831 915 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC6A7Q99884 636 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 IFT46Q9NQC8 304 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CACNA1EQ15878 2313 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 AGAP14A8MT82 685 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 E9PI62 339 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OLFM2O95897 454 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 EVX1P49640 407 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ART1P52961 327 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CHAF1BQ13112 559 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ASAH1Q13510 395 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ARFRP1Q13795 201 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 FGL2Q14314 439 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 HBMQ6B0K9 141 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 KDM8Q8N371 416 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR7G1Q8NGA0 311 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 Q96M85 177 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 SDF2Q99470 211 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 ICKQ9UPZ9 632 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR2AT4A6NND4 320 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CDC42EP2O14613 210 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 FGF17O60258 216 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 GPR75O95800 540 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PGAM2P15259 253 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 HLA-DMAP28067 261 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 IGFALSP35858 605 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR1D4P47884 311 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 OR3A3P47888 321 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 CEBPGP53567 150 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
ANKRD42-202ENST00000393389 IRF3Q14653 427 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms