RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR11L1Q8NGX0 322 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NUBPLQ8TB37 319 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 UBTD2Q8WUN7 234 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 C3orf30Q96M34 536 aa4.04□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 HMGCLL1Q8TB92 370 aa4.04□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 OR1E2P47887 323 aa4.04□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 COQ8BQ96D53 544 aa4.04□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 EMC6Q9BV81 110 aa4.04□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 AQP7O14520 342 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GADD45GO95257 159 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PNMTP11086 282 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 COX4I1P13073 169 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
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