RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 MYL12BO14950 172 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 TUBA1BP68363 451 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 MED22Q15528 200 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 TUBA1AQ71U36 451 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 NAXDQ8IW45 347 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 OR51A7Q8NH64 312 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 HGDQ93099 445 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HPS1-202ENST00000338546 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.84□□□□□ -0.03
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HPS1-202ENST00000338546 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 AGRPO00253 132 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 CCRL2O00421 344 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ARPC3O15145 178 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 CBFA2T3O75081 653 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ADRA2AP08913 450 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ZNF3P17036 446 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 UGT2B10P36537 528 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 HTR3AP46098 478 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 DLX5P56178 289 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 AQP6Q13520 282 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 EXT1Q16394 746 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 CPOQ8IVL8 374 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ELP5Q8TE02 316 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 DDA1Q9BW61 102 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 WDR70Q9NW82 654 aa14.83□□□□□ -0.04
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HPS1-202ENST00000338546 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 R4GN57 208 aa14.83□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 AIREO43918 545 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 GP1BBP13224 206 aa14.82□□□□□ -0.04
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HPS1-202ENST00000338546 PTNP21246 168 aa14.82□□□□□ -0.04
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HPS1-202ENST00000338546 PCOLCEQ15113 449 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ZNF74Q16587 644 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 M1APQ8TC57 530 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 TMEM234Q8WY98 164 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 OR5M11Q96RB7 305 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 HAO2Q9NYQ3 351 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.82□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ADAM10O14672 748 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 IMPA2O14732 288 aa14.81□□□□□ -0.04
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HPS1-202ENST00000338546 MSX1P28360 303 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 MLLT10P55197 1068 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ITGADQ13349 1161 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SPCS2Q15005 226 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 DESI1Q6ICB0 168 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 NIPAL3Q6P499 406 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 GRINAQ7Z429 371 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 GPR119Q8TDV5 335 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 ST8SIA1Q92185 356 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 TAAR9Q96RI9 348 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 MMP25Q9NPA2 562 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-202ENST00000338546 INPP5EQ9NRR6 644 aa14.81□□□□□ -0.04
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