RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM43Q9BTV4 400 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF426Q9BUY5 554 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTTY12Q9BZ98 90 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT84Q9NSB2 600 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM5Q9Y2B1 443 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 EML6Q6ZMW3 1958 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACOT7O00154 380 aa24.85■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GASTP01350 101 aa24.85■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGBD2Q6P3X8 592 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa24.85■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRG3Q86Y34 549 aa24.85■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IGF2RP11717 2491 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHISA8B8ZZ34 492 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIP5K1CO60331 668 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 RFPL3SP0C7P2 107 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFI30P13284 250 aa24.84■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CBLP22681 906 aa24.84■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP2K6P52564 334 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAD23AP54725 363 aa24.84■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A16Q86VW1 577 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 P3H2Q8IVL5 708 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PFN4Q8NHR9 129 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGQQ9BRB3 760 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFHX4Q86UP3 3567 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 C7orf72A4D263 438 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZIC3O60481 467 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPIAP62937 165 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKCDQ05655 676 aa24.83■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RFX4Q33E94 735 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDM4DQ6B0I6 523 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf94Q6P1W5 598 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZER1Q7Z7L7 766 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 POC1BQ8TC44 478 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGCR6LQ9BY27 220 aa24.83■■□□□ 1.57
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBQLN3Q9H347 655 aa24.83■■□□□ 1.57
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM72A0PK05 275 aa24.82■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM166BA8MTA8 275 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 A8MVM7 634 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 H0YJX3 145 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF17P17021 662 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD34AQ69YU3 496 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf46Q6UWT4 87 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DDIT4LQ96D03 193 aa24.82■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa24.82■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSTM3P21266 225 aa24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 AQP4P55087 323 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTBP2P56545 445 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 C3orf33Q6P1S2 294 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALNT5Q7Z7M9 940 aa24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 STK35Q8TDR2 534 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGTBQ96EQ0 304 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 RDH12Q96NR8 316 aa24.81■■□□□ 1.56
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2B2Q9GZK3 357 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENOPH1Q9UHY7 261 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF208O43345 1280 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLSO94925 669 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDGFAP04085 211 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 TFPIP10646 304 aa24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELK4P28324 431 aa24.81■■□□□ 1.56
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