RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK20Q8IZL9 346 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8K5Q8NH50 307 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 NT5CQ8TCD5 201 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 UFD1Q92890 307 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 WDFY2Q96P53 400 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OPALINQ96PE5 141 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR7D2Q96RA2 312 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SERINC2Q96SA4 455 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FUZQ9BT04 418 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 XKR8Q9H6D3 395 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNK6Q9Y257 313 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PR48 441 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 M0R3H8 397 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MASP2O00187 686 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 DSCR3O14972 297 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RGS5O15539 181 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 UBXN7O94888 489 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SOX14O95416 240 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RECKO95980 971 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF5P12034 268 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CPEP16870 476 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP11P24347 488 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FPR3P25089 353 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SDC2P34741 201 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MTNR1AP48039 350 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC9A3P48764 834 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1CAP62136 330 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SKP1P63208 163 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 BTN3A2P78410 334 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF17Q02223 184 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SCN1BQ07699 218 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TPBGQ13641 420 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 IL11RAQ14626 422 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SYT14P1Q58G82 188 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF425Q6IV72 752 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC73Q6P1J9 531 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MZT2AQ6P582 158 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM107Q6UX40 140 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MRGPREQ86SM8 312 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC190Q86UF4 302 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PAQR7Q86WK9 346 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 GID4Q8IVV7 300 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR8H2Q8N162 312 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RSC1A1Q92681 617 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MR1Q95460 341 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ELP4Q96EB1 424 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RNFT2Q96EX2 444 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNDC15Q96J42 360 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 LRR1Q96L50 414 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 KCTD7Q96MP8 289 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5M11Q96RB7 305 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPOQ9BU64 300 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MED18Q9BUE0 208 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR87Q9BY21 358 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.47□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 LYRM4Q9HD34 91 aa6.47□□□□□ -1.37
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