RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.39□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SURF4O15260 269 aa7.39□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TSPAN12O95859 305 aa7.39□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 GNG2P59768 71 aa7.39□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TUBA3CQ13748 450 aa7.39□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 SLC38A5Q8WUX1 472 aa7.39□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 MT-ND2P03891 347 aa7.39□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ZNF883P0CG24 379 aa7.39□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 MXD1Q05195 221 aa7.39□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.39□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 D2HGDHQ8N465 521 aa7.39□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SYT14Q8NB59 555 aa7.39□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 MICU1Q9BPX6 476 aa7.39□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 CXorf21Q9HAI6 301 aa7.39□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.39□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 OPN1LWP04000 364 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MAP2K6P52564 334 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TMPRSS3P57727 454 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ERVK-25P63136 954 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 BTG2P78543 158 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 RELAQ04206 551 aa7.38□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 POC5Q8NA72 575 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.38□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 GPR78Q96P69 363 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 DVL2O14641 736 aa7.38□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 MTNR1AP48039 350 aa7.38□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 HERV-K104P61576 105 aa7.38□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 OLFML2AQ68BL7 652 aa7.38□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.38□□□□□ -1.23
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NANOG-201ENST00000229307 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 TRIB1Q96RU8 372 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MOKQ9UQ07 419 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 MEMO1Q9Y316 297 aa7.38□□□□□ -1.23
NANOG-201ENST00000229307 SCGB2A1O75556 95 aa7.38□□□□□ -1.23
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