RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nup214Q80U93 2085 aa11.74□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp981A2A8V7 445 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dmrtb1A2A9I7 359 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xlr5aA2BI45 236 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp282E9PVC2 666 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcl2a1dO55179 172 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FcamrQ2TB54 535 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd2bQ3T9M1 494 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup20Q5FW60 181 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thoc6Q5U4D9 341 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd3eapQ76KJ5 399 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr176Q80WT4 515 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abhd16bQ80YU0 474 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tm9sf4Q8BH24 643 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam69cQ8BQT2 410 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Unc119bQ8C4B4 251 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam4Q8CGQ2 763 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aoc1Q8JZQ5 751 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Faim2Q8K097 317 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gipc3Q8R5M0 297 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1284Q8VF29 311 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb16Q91Y03 802 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sntg1Q925E1 517 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a30Q9CR58 291 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MmabQ9D273 237 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Piezo1E2JF22 2547 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21865A0A087WRL2 222 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7145A0A087WS64 360 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cela3aA2A9U8 283 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20403G3UYB0 123 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr738L7N1X7 311 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KeraO35367 351 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ulk1O70405 1051 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OsmrO70458 971 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nfatc1O88942 717 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klk1b9P15949 261 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam187bQ0VAY3 358 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serinc4Q5XK03 492 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pla2g7Q60963 440 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pgr15lQ80T54 456 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chst14Q80V53 376 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 McubQ810S1 345 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Poldip3Q8BG81 420 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oscp1Q8BHW2 379 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ablim2Q8BL65 612 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssuh2Q8C3L1 340 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem163Q8C996 288 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Calhm5Q8R100 309 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1390Q8VGW9 311 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpx6Q91WR8 221 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tssk6Q925K9 273 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Timm22Q9CQ85 194 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CenpnQ9CZW2 337 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D4G1 230 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actl11Q9D5V1 1207 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phospho2Q9D9M5 241 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RgccQ9DBX1 137 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slco2a1Q9EPT5 643 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oc90Q9Z0L3 485 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sdccag3A2AIW0 432 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptrhd1D3Z4S3 140 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3542K7N6U2 270 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a1O08966 556 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nmur1O55040 428 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arpc4P59999 168 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp41Q02526 198 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apoc2Q05020 97 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtf1Q07243 675 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HgfQ08048 728 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif1aQ60872 144 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ManeaQ6NXH2 462 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alg8Q6P8H8 526 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo46Q8BG80 603 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ahsa2Q8N9S3 331 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpusd1Q8VCZ8 306 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr815Q8VFU0 316 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnmt3lQ9CWR8 421 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prelid3bQ9CYY7 195 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erp27Q9D8U3 272 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cypt12Q9DAR6 119 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lbx2Q9WUN8 195 aa11.73□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Loxhd1C8YR32 2068 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MpdzQ8VBX6 2055 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r18E9Q280 788 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr172E9Q8F6 309 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r13G5E8I3 300 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FkbplO35450 347 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EnamO55196 1274 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tgfb1P04202 390 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bmp8aP34821 399 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crtc2Q3U182 692 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC030870Q3V2G4 71 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r110Q7M712 333 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r104Q7M723 302 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr152Q8BXS7 511 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NdnfQ8C119 568 aa11.72□□□□□ -0.53
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lin28aQ8K3Y3 209 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.7 ms