RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637391.1

ARHGEF9-231, Transcript of Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9, human

TSL 5

Gene ARHGEF9, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	OR7G2	Q8NG99	324 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ESAM	Q96AP7	390 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ITPKC	Q96DU7	683 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	LYST	Q99698	3801 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	PLOD3	O60568	738 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	KLK1	P06870	262 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	NGFR	P08138	427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	MELTF	P08582	738 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	NR4A1	P22736	598 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CD80	P33681	288 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	SLC16A1	P53985	500 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	PHEX	P78562	749 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	EGR3	Q06889	387 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	BST1	Q10588	318 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	FOXF1	Q12946	379 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CFHR4	Q92496	578 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	RBBP8	Q99708	897 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391		Q9N2J8	555 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391		H0YIV9	168 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	MGRN1	O60291	552 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	SEMA3D	O95025	777 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	KCNH1	O95259	989 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	NAT2	P11245	290 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	IGLL1	P15814	213 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CBR1	P16152	277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	GLRX	P35754	106 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	MAGEB1	P43366	347 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	PRIM2	P49643	509 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	DIO1	P49895	249 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	LCP2	Q13094	533 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	TRADD	Q15628	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	CCNG2	Q16589	344 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ARHGEF9-231	ENST00000637391	STX1A	Q16623	288 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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