RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634931.1

SMARCA2-231, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SMARCA2, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-231	ENST00000634931	ELOC	Q15369	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	VASH2	Q86V25	355 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	NAT6	Q93015	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	S1PR3	Q99500	378 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PISD	Q9UG56	409 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931		A0A087WW49	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931		A0A0U1RRA0	63 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	P2RX6	O15547	441 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	KCNAB3	O43448	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SSX5	O60225	188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TNF	P01375	233 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PCCB	P05166	539 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	UMOD	P07911	640 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SDC4	P31431	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ASMT	P46597	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC6A12	P48065	614 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	RHOA	P61586	193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	HTD2	P86397	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SYCP1	Q15431	976 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CYTH1	Q15438	398 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TAB1	Q15750	504 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	C3AR1	Q16581	482 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931		Q6ZVQ6	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	NLRP14	Q86W24	1093 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	GPR137	Q96N19	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	ASCL2	Q99929	193 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931		D6RAR5	112 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	SURF4	O15260	269 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR6A2	O95222	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	LCA5L	O95447	670 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCA2-231	ENST00000634931	IGSF6	O95976	241 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms