RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 UBL4AP11441 157 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF23P17027 643 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 MST1LQ2TV78 715 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 WDR31Q8NA23 367 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 ST8SIA1Q92185 356 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 MTERF3Q96E29 417 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 FBXO17Q96EF6 278 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 C1orf159Q96HA4 380 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.79□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 SLC28A1O00337 649 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 DNAJA2O60884 412 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 GCAP28676 217 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 NTF4P34130 210 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 SYT14P1Q58G82 188 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 FMO2Q99518 471 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.78□□□□□ -0.04
FCHO1-230ENST00000600058 G3V2L1 256 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 PDLIM1O00151 329 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 KRT16P08779 473 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 MYL2P10916 166 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 ITGA2P17301 1181 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 CFPP27918 469 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 ASMTP46597 345 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 SLC16A1P53985 500 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 SESN3P58005 492 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 SLC25A3Q00325 362 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 MERTKQ12866 999 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 SKP2Q13309 424 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 CARTPTQ16568 116 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 OR2T11Q8NH01 316 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 PIGXQ8TBF5 258 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 SOX7Q9BT81 388 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 LAT2Q9GZY6 243 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 ADAM19Q9H013 955 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 EMCNQ9ULC0 261 aa14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 SERINC4A6NH21 518 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 DNPH1O43598 174 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 NEFHP12036 1026 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 TP53BP2Q13625 1128 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 CFAP157Q5JU67 520 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 TMEM234Q8WY98 164 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 ACER3Q9NUN7 267 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 MOKQ9UQ07 419 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.76□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 CYP7B1O75881 506 aa14.75□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 PMS2P2O95744 297 aa14.75□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 TFPIP10646 304 aa14.75□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 PGCP20142 388 aa14.75□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 TGFBR3Q03167 851 aa14.75□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.75□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.75□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.75□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.75□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
FCHO1-230ENST00000600058 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms