RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ESAMQ96AP7 390 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC58Q96CX6 371 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TCEAL4Q96EI5 215 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ASCL2Q99929 193 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 NTMT1Q9BV86 223 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC29A3Q9BZD2 475 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 IL1RL2Q9HB29 575 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR173Q9NS66 373 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ELOVL2Q9NXB9 296 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CD300AQ9UGN4 299 aa3.8□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 SNX6Q9UNH7 406 aa3.8□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.8□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 LINC01553A4QN01 128 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 C9JVG2 144 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 C5orf67F2Z3F1 127 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 F8VVB4 439 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 F8VWA3 439 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 F8WDY8 70 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ARPC2O15144 300 aa3.79□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 H1F0P07305 194 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 AKT2P31751 481 aa3.79□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 PDK3Q15120 406 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MTX3Q5HYI7 312 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PAGE3Q5JUK9 113 aa3.79□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 C10orf25Q5T742 122 aa3.79□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZSR9 355 aa3.79□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 PIP4P1Q86T03 277 aa3.79□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 HCAR2Q8TDS4 363 aa3.79□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 BADQ92934 168 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R16AQ96I34 528 aa3.79□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 FOPNLQ96NB1 174 aa3.79□□□□□ -1.8
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