RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.69□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 C7orf72A4D263 438 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR5H15A6NDH6 313 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 H0Y3Z8 333 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 H3BNX3 289 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ACOT7O00154 380 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CHP2O43745 196 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR2T1O43869 369 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ICOSLGO75144 302 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TIPRLO75663 272 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A12O75746 678 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CEACAM4O75871 244 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CCNB2O95067 398 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 NUDT14O95848 222 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ADAP00813 363 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CAPNS1P04632 268 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC159P0C7I6 412 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ITGAMP11215 1152 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CNR1P21554 472 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FUT4P22083 530 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ALDH3A2P51648 485 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 EFNA3P52797 238 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ARG2P78540 354 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SPIBQ01892 262 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 INAQ16352 499 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 NNATQ16517 81 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MICAQ29983 383 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 WLSQ5T9L3 541 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 BORAQ6PGQ7 559 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DEF8Q6ZN54 512 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GRINAQ7Z429 371 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.68□□□□□ -1.34
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SMAD4-210ENST00000590061 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.68□□□□□ -1.34
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SMAD4-210ENST00000590061 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF597Q96LX8 424 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ACER3Q9NUN7 267 aa6.68□□□□□ -1.34
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SMAD4-210ENST00000590061 MED31Q9Y3C7 131 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RNF114Q9Y508 228 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SPTA1P02549 2419 aa6.68□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ARGFXA6NJG6 315 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 NKX2-8O15522 239 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF208O43345 1280 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TPST1O60507 370 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1D-16P01601 117 aa6.67□□□□□ -1.34
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SMAD4-210ENST00000590061 HIST1H2ABP04908 130 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CD8BP10966 210 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF17P17021 662 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CXCR1P25024 350 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ELK4P28324 431 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SOX3P41225 446 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CASP3P42574 277 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SLC9A3P48764 834 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CRYBA2P53672 197 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 UGT2B15P54855 530 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CDH12P55289 794 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DLX5P56178 289 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 NUP107P57740 925 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FBXW4P57775 412 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ESRRGP62508 458 aa6.67□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 VLDLRP98155 873 aa6.67□□□□□ -1.34
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