RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	SEMA7A	O75326	666 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	PRSS23	O95084	383 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	IGHG3	P01860	377 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	ELK4	P28324	431 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	PMP22	Q01453	160 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	MERTK	Q12866	999 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	STMN2	Q93045	179 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	C3orf49	Q96BT1	292 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	PRR14	Q9BWN1	585 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691		A0A1W2PRQ8	180 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	FFAR1	O14842	300 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	CHP2	O43745	196 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	ACTL6A	O96019	429 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	CXCR1	P25024	350 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	MST1	P26927	711 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	TACR3	P29371	465 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	ERF	P50548	548 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	HMGA2	P52926	109 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	CDH12	P55289	794 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	DGCR6	Q14129	220 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	TRAM2	Q15035	370 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	SIAH3	Q8IW03	269 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	OR2T29	Q8NH02	315 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	POC1B	Q8TC44	478 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF524	Q96C55	264 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	S100A14	Q9HCY8	104 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TBCD-223	ENST00000576691	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691		A0A087WUJ7	227 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691		A0A1B0GVC2	190 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	OR2M5	A3KFT3	312 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691		H0YHG0	523 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF208	O43345	1280 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	CST1	P01037	141 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	FAS	P25445	335 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	GFRA1	P56159	465 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	RAC1	P63000	192 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	FOXF1	Q12946	379 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	BCL2A1	Q16548	175 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	COLEC12	Q5KU26	742 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	RAET1L	Q5VY80	246 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	ELOA3	Q8NG57	546 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	FAR1	Q8WVX9	515 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SFXN2	Q96NB2	322 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	LDAH	Q9H6V9	325 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691	GJE1	A6NN92	205 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TBCD-223	ENST00000576691		J3KTA2	159 aa		15.19	■□□□□ 0.02

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