RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 CLEC9AQ6UXN8 241 aa10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 HMGN2P46Q86SG4 172 aa10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 OIT3Q8WWZ8 545 aa10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 NEUROG1Q92886 237 aa10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 ARL5BQ96KC2 179 aa10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 INPP5KQ9BT40 448 aa10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 POLE3Q9NRF9 147 aa10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 AIG1Q9NVV5 245 aa10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 BTNL2Q9UIR0 455 aa10.46□□□□□ -0.73
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF716A6NP11 495 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 RAMP1O60894 148 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 SNNO75324 88 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 CYP7B1O75881 506 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 PGM3O95394 542 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 HEXAP06865 529 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 DIO1P49895 249 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 MVDP53602 400 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 NME5P56597 212 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNJ10P78508 379 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 H3F3AP84243 136 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 ITGADQ13349 1161 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 SYPL1Q16563 259 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 C3orf33Q6P1S2 294 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZT83 130 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 C16orf62Q7Z3J2 963 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF619Q8N2I2 560 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKFN1Q8N957 763 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 HSD17B8Q92506 261 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 OR5B2Q96R09 309 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNK9Q9NPC2 374 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 FANCFQ9NPI8 374 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 CTPS2Q9NRF8 586 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC6A13Q9NSD5 602 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 EXD2Q9NVH0 621 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 KLHL9Q9P2J3 617 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 PCDHGB4Q9UN71 923 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 WDR45Q9Y484 360 aa10.45□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 ALPK2Q86TB3 2170 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC154A6NI56 674 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 AGAP5A6NIR3 686 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 E9PBE3 544 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 AP3D1O14617 1153 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 TMCC2O75069 709 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 AGR2O95994 175 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 CD8AP01732 235 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 CHRM4P08173 479 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 SOD3P08294 240 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 PGCP20142 388 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 COX5AP20674 150 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV1-2P23083 117 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC7A1P30825 629 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A3P33764 101 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 CCR4P51679 360 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 MERTKQ12866 999 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 PDK3Q15120 406 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 DPY19L1Q2PZI1 675 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 SYT14P1Q58G82 188 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 COX20Q5RI15 118 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF130Q86XS8 419 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 VPS37AQ8NEZ2 397 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM234Q8WY98 164 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC35A5Q9BS91 424 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 BDH2Q9BUT1 245 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 OR11A1Q9GZK7 315 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 ABCA2Q9BZC7 2435 aa10.44□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa10.43□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 GOLGA8OA6NCC3 632 aa10.43□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 GOLGA8NF8WBI6 632 aa10.43□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 SULT2B1O00204 365 aa10.43□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 LYZL6O75951 148 aa10.43□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 GSNP06396 782 aa10.43□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 PGRP06401 933 aa10.43□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 FESP07332 822 aa10.43□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 EPHA3P29320 983 aa10.43□□□□□ -0.74
CLSTN3-211ENST00000541667 RYKP34925 604 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms