RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 NUDT15Q9NV35 164 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 B3GNT2Q9NY97 397 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 KLK13Q9UKR3 277 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SMARCA4P51532 1647 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 FRG2CA6NGY1 282 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 K7ENP7 123 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP5LO75964 103 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 GNA14O95837 355 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 GNA11P29992 359 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 YWHABP31946 246 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 CCR1P32246 355 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 LEPP41159 167 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGEA9P43362 315 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 QARSP47897 775 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 DAP3P51398 398 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 OGDHQ02218 1023 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PLD1Q13393 1074 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 RUNX3Q13761 415 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC26Q8TAB7 109 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ST8SIA1Q92185 356 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 RASL10AQ92737 203 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 TOMM40LQ969M1 308 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 MS4A14Q96JA4 679 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 NUP58Q9BVL2 599 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF385DQ9H6B1 395 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SMYD3Q9H7B4 428 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 MIEF1Q9NQG6 463 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF581Q9P0T4 197 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PHF11Q9UIL8 331 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 TMED5Q9Y3A6 229 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 TRDCB7Z8K6 153 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SULT2B1O00204 365 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 HAS3O00219 553 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 OR10H3O60404 316 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PFKFB2O60825 505 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF883P0CG24 379 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC35E2P0CK97 266 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ADORA2BP29275 332 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 NMT1P30419 496 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP5OP48047 213 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SERINC5Q86VE9 423 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE2E3Q969T4 207 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 DPH7Q9BTV6 452 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 CUTCQ9NTM9 273 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PISDQ9UG56 409 aa5.98□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ADGRL1O94910 1474 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 HEATR9A2RTY3 570 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 UPK3AO75631 287 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 CABYRO75952 493 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS14P62263 151 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 VGLL4Q14135 290 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 SERTAD2Q14140 314 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 RCN1Q15293 331 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR65Q8IYL9 337 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM110BQ8TC76 370 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 NR4A3Q92570 626 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 CCT8L2Q96SF2 557 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB34Q9BZG1 259 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB20Q9NX57 234 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PRSS21Q9Y6M0 314 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 PEG3Q9GZU2 1588 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 IFT140Q96RY7 1462 aa5.96□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 KDM6BO15054 1643 aa5.96□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.96□□□□□ -1.45
PGGT1B-205ENST00000514178 CLASP1Q7Z460 1538 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 E7ESA3 106 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLGA8SH3BPF8 625 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 FOLR2P14207 255 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 EPHX2P34913 555 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL34P49207 117 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 PRRX1P54821 245 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 CDK16Q00536 496 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 GK3PQ14409 553 aa5.96□□□□□ -1.46
PGGT1B-205ENST00000514178 QRICH1Q2TAL8 776 aa5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms