RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SCD	O00767	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ADH4	P08319	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	DANCR	P0C864	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ACP2	P11117	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PPP3CB	P16298	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PTN	P21246	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	EDNRA	P25101	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	NTS	P30990	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GABRA3	P34903	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MPI	P34949	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SFTPD	P35247	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PRIM2	P49643	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SERPINB9	P50453	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CTBP2	P56545	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	RAC3	P60763	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PSPH	P78330	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FOXF1	Q12946	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	LCP2	Q13094	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ODF1	Q14990	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TAB1	Q15750	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CD226	Q15762	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PGGHG	Q32M88	737 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	HTRA1	Q92743	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	EMCN	Q9ULC0	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATXN3-210	ENST00000507965	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965		A0A1W2PP18	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CD5L	O43866	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	EFNA2	O43921	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GPRIN2	O60269	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	RAMP1	O60894	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	NKX2-2	O95096	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SYNGR4	O95473	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	KNG1	P01042	644 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TUBB	P07437	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TAC1	P20366	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	IMPDH1	P20839	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CASQ1	P31415	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	MAP3K8	P41279	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PRKAG1	P54619	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SCAND1	P57086	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF117	Q03924	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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