RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 EPS15L1Q9UBC2 864 aa2.22□□□□□ -2.05
SENP6-208ENST00000483859 LCMT1Q9UIC8 334 aa2.22□□□□□ -2.05
SENP6-208ENST00000483859 RASD1Q9Y272 281 aa2.22□□□□□ -2.05
SENP6-208ENST00000483859 WDR45Q9Y484 360 aa2.22□□□□□ -2.05
SENP6-208ENST00000483859 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 A0A1B0GUS0 222 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 NDC80O14777 642 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 IDH1O75874 414 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 KIAA0754O94854 1291 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 LRATO95237 230 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 OPN1MWP04001 364 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 H2BFMP0C1H6 154 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 ZNF853P0CG23 659 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 OPN1MW2P0DN77 364 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 OPN1MW3P0DN78 364 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 NCK1P16333 377 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 HOXD10P28358 340 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 PTGDSP41222 190 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 IFNAR2P48551 515 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 CASP4P49662 377 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 TRIM16LQ309B1 348 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 OR2G6Q5TZ20 316 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 MOB3BQ86TA1 216 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 PPP1R27Q86WC6 154 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 VSTM4Q8IW00 320 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 SLC34A3Q8N130 599 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 SVOPLQ8N434 492 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 TMEM252Q8N6L7 170 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 FAM110BQ8TC76 370 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 SLC5A11Q8WWX8 675 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 PIGCQ92535 297 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 DCUN1D4Q92564 292 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 RAPGEF5Q92565 580 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 MAGEB18Q96M61 343 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 OMDQ99983 421 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 VCPKMTQ9H867 229 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 POPDC2Q9HBU9 364 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 MARCH5Q9NX47 278 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 HOXC10Q9NYD6 342 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 RNF14Q9UBS8 474 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 PCSK1NQ9UHG2 260 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 PLLPQ9Y342 182 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 MEGF6O75095 1541 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 KDRP35968 1356 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 TNRQ92752 1358 aa2.21□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 SCN2AQ99250 2005 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 A0A0J9YXY3 114 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 H0YCG3 227 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 ARPC3O15145 178 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 EMC8O43402 210 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 HCN1O60741 890 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 ADCY5O95622 1261 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 IGHG4P01861 327 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 BTDP43251 543 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 VGLL4Q14135 290 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 CCDC14Q49A88 953 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 RFLNAQ6ZTI6 216 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 C6orf223Q8N319 242 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 MTURNQ8N3F0 131 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 DHRSXQ8N5I4 330 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 ALLCQ8N6M5 410 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 OR52M1Q8NGK5 317 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 TGM7Q96PF1 710 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 GAL3ST1Q99999 423 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 GORASP2Q9H8Y8 452 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 UFSP2Q9NUQ7 469 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 SMOXQ9NWM0 555 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 PIPOXQ9P0Z9 390 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 SNX6Q9UNH7 406 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 NEU3Q9UQ49 428 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa2.2□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 PSMB11A5LHX3 300 aa2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 USP27XA6NNY8 438 aa2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 TRDCB7Z8K6 153 aa2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 NPIPA7E9PJI5 369 aa2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 SNNO75324 88 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 SPAG6O75602 509 aa2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 MMP23AO75900 390 aa2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 SUPT7LO94864 414 aa2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 STAMBPO95630 424 aa2.19□□□□□ -2.06
SENP6-208ENST00000483859 LGI1O95970 557 aa2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms