RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 RNF138Q8WVD3 245 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 XAGE5Q8WWM1 108 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 TMEM158Q8WZ71 300 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 RAB8BQ92930 207 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 CCDC115Q96NT0 180 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 PIGQQ9BRB3 760 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 KLHL4Q9C0H6 718 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 RMND5AQ9H871 391 aa10.46□□□□□ -0.73
PRAME-210ENST00000442481 RNF122Q9H9V4 155 aa10.46□□□□□ -0.73
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PRAME-210ENST00000442481 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
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PRAME-210ENST00000442481 SOX30O94993 753 aa10.44□□□□□ -0.74
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PRAME-210ENST00000442481 FESP07332 822 aa10.44□□□□□ -0.74
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PRAME-210ENST00000442481 LCN1P31025 176 aa10.44□□□□□ -0.74
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PRAME-210ENST00000442481 CTBP2P56545 445 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 ZNF117Q03924 483 aa10.44□□□□□ -0.74
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PRAME-210ENST00000442481 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 NDUFAF6Q330K2 333 aa10.44□□□□□ -0.74
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PRAME-210ENST00000442481 C16orf89Q6UX73 402 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 MISPQ8IVT2 679 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 OR6K3Q8NGY3 331 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 GTF2H4Q92759 462 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 NEURL3Q96EH8 262 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 SDF2Q99470 211 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 GLRX2Q9NS18 164 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 GID8Q9NWU2 228 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 CARD8Q9Y2G2 431 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.44□□□□□ -0.74
PRAME-210ENST00000442481 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.44□□□□□ -0.74
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