RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GDE1Q9NZC3 331 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 HIDE1A8MVS5 230 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GPR18Q14330 331 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 GPR150Q8NGU9 434 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RNF39Q9H2S5 420 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 EHFQ9NZC4 300 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MED17Q9NVC6 651 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SHPRHQ149N8 1683 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 RNF4P78317 190 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 H3BML4 177 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 IL23AQ9NPF7 189 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 J3QR89 54 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SCGB1D1O95968 90 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 PPP3CBP16298 524 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 OR7A5Q15622 319 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CCL14Q16627 93 aa6.27□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 USP53Q70EK8 1073 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TCTN2Q96GX1 697 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GINS3Q9BRX5 216 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DPH1Q9BZG8 443 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 NIPAL2Q9H841 368 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RNF24Q9Y225 148 aa6.27□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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