RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 MST1LQ2TV78 715 aa6.94□□□□□ -1.3
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LINC00578-201ENST00000439009 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.94□□□□□ -1.3
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LINC00578-201ENST00000439009 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 RIPK1Q13546 671 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 MLC1Q15049 377 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 CHI3L2Q15782 390 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 GABRA6Q16445 453 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF385BQ569K4 471 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00578-201ENST00000439009 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.92□□□□□ -1.3
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