RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.04■□□□□ 0.16
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PTPRF-209ENST00000438120 CENPBD1B2RD01 187 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-209ENST00000438120 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-209ENST00000438120 TSPAN15O95858 294 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-209ENST00000438120 TNFRSF17Q02223 184 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-209ENST00000438120 CAMK2DQ13557 499 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-209ENST00000438120 SIMC1Q8NDZ2 872 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-209ENST00000438120 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-209ENST00000438120 RABL2BQ9UNT1 228 aa16.02■□□□□ 0.16
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