RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 CCNA2P20248 432 aa24.41■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 IL18R1Q13478 541 aa24.41■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 MDGA2Q7Z553 956 aa24.41■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 KIF18BQ86Y91 864 aa24.41■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 PITX2Q99697 317 aa24.41■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 APOL4Q9BPW4 351 aa24.41■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 WISP1O95388 367 aa24.4■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 LYNP07948 512 aa24.4■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 SNTA1Q13424 505 aa24.4■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 ABHD17BQ5VST6 288 aa24.4■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 RTL4Q6ZR62 310 aa24.4■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 ZNF786Q8N393 782 aa24.4■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 SH2D2AQ9NP31 389 aa24.4■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 GGT2P36268 569 aa24.39■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 SLC30A6Q6NXT4 461 aa24.39■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 ARSKQ6UWY0 536 aa24.39■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 SETD9Q8NE22 299 aa24.39■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 UBE2FQ969M7 185 aa24.39■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 SCNM1Q9BWG6 230 aa24.39■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 OSGIN1Q9UJX0 560 aa24.39■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 TMEM5Q9Y2B1 443 aa24.39■■□□□ 1.5
MSX1-201ENST00000382723 A6NL46 340 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ENO4A6NNW6 628 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SAGP10523 405 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CTBP2P56545 445 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ISL1P61371 349 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 FAM81AQ8TBF8 368 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 THAP4Q8WY91 577 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SGCZQ96LD1 299 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ANGPTL4Q9BY76 406 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CPNE5Q9HCH3 593 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 AASSQ9UDR5 926 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 VDAC3Q9Y277 283 aa24.39■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 MAGEA13PA6NCF6 341 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 UNC119BA6NIH7 251 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ZAR1LA6NP61 321 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CXCR1P25024 350 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ELK4P28324 431 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 MSX1P28360 303 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 HLCSP50747 726 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CD47Q08722 323 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 RASSF1Q9NS23 344 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ASPMQ8IZT6 3477 aa24.38■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 EFCAB9A8MZ26 197 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CYB561P49447 251 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TMEM81Q6P7N7 255 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 LINC00696Q6ZRV3 163 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 GALNT16Q8N428 558 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 IQCF1Q8N6M8 205 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 WDSUB1Q8N9V3 476 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 FBXL2Q9UKC9 423 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 OR2M3Q8NG83 312 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 OR4K17Q8NGC6 315 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CNIH3Q8TBE1 160 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TMEM234Q8WY98 164 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 C12orf10Q9HB07 376 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 PROK2Q9HC23 129 aa24.37■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 M0R129 80 aa24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 RPS6KA3P51812 740 aa24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 RRADP55042 308 aa24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 GRINAQ7Z429 371 aa24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 OR13C2Q8NGS9 318 aa24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TEX47Q8TBZ9 253 aa24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 FRMD6Q96NE9 622 aa24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 NPAS1Q99742 590 aa24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ABI3Q9P2A4 366 aa24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 IL20RAQ9UHF4 553 aa24.36■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 LRRN3E7EW58 273 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TNFAIP8O95379 198 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 P04436 131 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 PRKCAP17252 672 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 MASP1P48740 699 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 ZNF620Q6ZNG0 422 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 OR8D4Q8NGM9 314 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 SGTBQ96EQ0 304 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TMEM43Q9BTV4 400 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 MED17Q9NVC6 651 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 RNF6Q9Y252 685 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 MYRFQ9Y2G1 1151 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa24.35■■□□□ 1.49
MSX1-201ENST00000382723 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms