RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CGAP01215 116 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 THBS1P07996 1170 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PRG2P13727 222 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SLC7A1P30825 629 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 KRTAP10-9P60411 292 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CDK6Q00534 326 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ADRM1Q16186 407 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 RNF220Q5VTB9 566 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 GRINAQ7Z429 371 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 COMTD1Q86VU5 262 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ADGRG3Q86Y34 549 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 RNF128Q8TEB7 428 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 C14orf79Q96F83 325 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ANKRD27Q96NW4 1050 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 OR5B2Q96R09 309 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SPATA9Q9BWV2 254 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PIGMQ9H3S5 423 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 TEX15Q9BXT5 2789 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CSMD1Q96PZ7 3565 aa13.35□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 EVPLLA8MZ36 301 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 FAAHO00519 579 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 FRS3O43559 492 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CCNA2P20248 432 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CPOXP36551 454 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CPA2P48052 419 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 TLE4Q04727 773 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SCARB2Q14108 478 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SYT14P1Q58G82 188 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF311Q5JNZ3 666 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 REP15Q6BDI9 236 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 FAM214BQ7L5A3 538 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SERPINA11Q86U17 422 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 PTOV1Q86YD1 416 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ZZZ3Q8IYH5 903 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ABHD3Q8WU67 409 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ARL5BQ96KC2 179 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SLC39A3Q9BRY0 314 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 OR11A1Q9GZK7 315 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM38AQ9H6F2 299 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 SERINC1Q9NRX5 453 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CRIM1Q9NZV1 1036 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ARMCX1Q9P291 453 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CHRNA9Q9UGM1 479 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 OSGIN1Q9UJX0 560 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 CORO2BQ9UQ03 480 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 IFT52Q9Y366 437 aa13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM72A0PK05 275 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 FXYD1O00168 92 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 MSTNO14793 375 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 PLGP00747 810 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 ETS2P15036 469 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 ENPP1P22413 925 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 TACR3P29371 465 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 AQP1P29972 269 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 SSTR2P30874 369 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 SEC24CP53992 1094 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 GYS2P54840 703 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 RAC3P60763 192 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 HOXC5Q00444 222 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 MYBPHQ13203 477 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 REEP3Q6NUK4 255 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 FCRLAQ7L513 359 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 SNX32Q86XE0 403 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF440Q8IYI8 595 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF610Q8N9Z0 462 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 LINC01560Q8TB33 94 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 LRRC46Q96FV0 321 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 KCNN3Q9UGI6 736 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 PROCRQ9UNN8 238 aa13.33□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 LRBAP50851 2863 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 MRASO14807 208 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 TPST1O60507 370 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 TFPIP10646 304 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 CD8BP10966 210 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 AGTR1P30556 359 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 CCKARP32238 428 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 SLC1A3P43003 542 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 KIR2DL3P43628 341 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 DIO1P49895 249 aa13.32□□□□□ -0.28
CSAG1-202ENST00000370287 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms