RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DEFB109BQ30KR1 87 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LINC00696Q6ZRV3 163 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCTD8Q6ZWB6 473 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZER1Q7Z7L7 766 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RHOXF1Q8NHV9 184 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUSP19Q8WTR2 217 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF138Q8WVD3 245 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTC9Q92623 222 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC41A3Q96GZ6 507 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HPF1Q9NWY4 346 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KLRF1Q9NZS2 232 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AASSQ9UDR5 926 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 G3V3Y1 287 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HCRTR2O43614 444 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FMO6PO60774 539 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADRB1P08588 477 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GDF7Q7Z4P5 450 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF227Q86WZ6 799 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 METTL7AQ9H8H3 244 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC160A6NGH7 325 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WBP4O75554 376 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CASP3P42574 277 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GSSP48637 474 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IDH2P48735 452 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR1Q1Q15612 314 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZSWIM7Q19AV6 140 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF730Q6ZMV8 503 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMIGD2Q96BF3 282 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLA2G3Q9NZ20 509 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEPT1Q9Y6K0 416 aa21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 APC2O95996 2303 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PTGES3LE9PB15 166 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 XPNPEP2O43895 674 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WISP1O95388 367 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GSTM3P21266 225 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POU1F1P28069 291 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TEKQ02763 1124 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 APH1BQ8WW43 257 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SGCDQ92629 289 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DUSP21Q9H596 190 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC24A3Q9HC58 644 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SH2D2AQ9NP31 389 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IMPAD1Q9NX62 359 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR83Q9NYM4 423 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POLHQ9Y253 713 aa21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRAPPC13A5PLN9 417 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCL11P51671 97 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDC42P60953 191 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZBED5Q49AG3 693 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RRM2BQ7LG56 351 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NKAIN4Q8IVV8 208 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPARTQ8N0X7 666 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CADM2Q8N3J6 435 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DCBLD2Q96PD2 775 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PROK2Q9HC23 129 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF226Q9NYT6 803 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC7A7Q9UM01 511 aa21.74■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HTR1AP08908 422 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RRADP55042 308 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABHD17BQ5VST6 288 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM236Q5W0B7 351 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDR88Q6ZMY6 472 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF550Q7Z398 422 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR141Q7Z602 305 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPACA3Q8IXA5 215 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OIT3Q8WWZ8 545 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LAT2Q9GZY6 243 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ICAM5Q9UMF0 924 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM20BO75063 409 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LYPD3O95274 346 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MST1P26927 711 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD96P40200 585 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 P3H2Q8IVL5 708 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIGXQ8TBF5 258 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PAQR8Q8TEZ7 354 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF559Q9BR84 538 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DPH1Q9BZG8 443 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa21.73■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MED11Q9P086 117 aa21.73■■□□□ 1.07
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