RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.22□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 GSG1Q2KHT4 349 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 PLA1AQ53H76 456 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CHST4Q8NCG5 386 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 OR2AT4A6NND4 320 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 B4GALT2O60909 372 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ITGA10O75578 1167 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SYN1P17600 705 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 BSGP35613 385 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ERVK-21P61565 698 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TREM1Q9NP99 234 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 HPF1Q9NWY4 346 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 SPACA6W5XKT8 324 aa14.21□□□□□ -0.13
USP25-201ENST00000285679 TGM5O43548 720 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 CEBPGP53567 150 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 MC2RQ01718 297 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 TRILQ7L0X0 811 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 THEM6Q8WUY1 208 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 LMF1Q96S06 567 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 FZD3Q9NPG1 666 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa14.21□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 AGAP14A8MT82 685 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 RRASP10301 218 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 SKP1P63208 163 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 FOXK2Q01167 660 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 LCN9Q8WX39 176 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 RNF186Q9NXI6 227 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 OR14I1A6ND48 311 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 S100A11P31949 105 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 GABRA3P34903 492 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 SP3Q02447 781 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 CAMK2DQ13557 499 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 KCTD9Q7L273 389 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 YIPF5Q969M3 257 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 DTD2Q96FN9 168 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 SEC22AQ96IW7 307 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 MNTQ99583 582 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 LINC00862A6NCI5 91 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 IGLON5A6NGN9 336 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 LDB3O75112 727 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 RECKO95980 971 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 DRD2P14416 443 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 HOXD10P28358 340 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 PGDP52209 483 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 NOGQ13253 232 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 LCTLQ6UWM7 567 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 HTR3DQ70Z44 454 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 MORN4Q8NDC4 146 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 C3orf49Q96BT1 292 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 GHITMQ9H3K2 345 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.2□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 SDC3O75056 442 aa14.19□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 OR6A2O95222 327 aa14.19□□□□□ -0.14
USP25-201ENST00000285679 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms