RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 FRYLO94915 3013 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 DMDP11532 3685 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZNF28P17035 718 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLC9A3P48764 834 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PNLIPRP2P54317 469 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 RAB40BQ12829 278 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PLBD1Q6P4A8 553 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PAQR6Q6TCH4 344 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 RTL4Q6ZR62 310 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 C10orf53Q8N6V4 93 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 APCDD1LQ8NCL9 501 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 FAM71CQ8NEG0 241 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 RTN4RQ9BZR6 473 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 RXFP3Q9NSD7 469 aa13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 IRGMA1A4Y4 181 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 VSTM2BA6NLU5 285 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PTP4A3O75365 173 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 LCN1P31025 176 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLC16A1P53985 500 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 FOXK2Q01167 660 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 TMEM44Q2T9K0 475 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 FAM69BQ5VUD6 431 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 LNX2Q8N448 690 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 LRRC17Q8N6Y2 441 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 MR1Q95460 341 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SPSB2Q99619 263 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 R4GN57 208 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 LNP1A1A4G5 178 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 WWP2O00308 870 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 CSO75390 466 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PPP1R3DO95685 299 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 TGFBR1P36897 503 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZNF117Q03924 483 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 AADACL4Q5VUY2 407 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 NXNL2Q5VZ03 156 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 POMZP3Q6PJE2 187 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 NANOGP1Q8N7R0 232 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ULBP3Q9BZM4 244 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 LAT2Q9GZY6 243 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 MED20Q9H944 212 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 GPR179Q6PRD1 2367 aa13.37□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 C17orf51A8MQB3 221 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SOCS6O14544 535 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PPM1BO75688 479 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PNMTP11086 282 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 CDK4P11802 303 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLC6A6P31641 620 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 GRK5P34947 590 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ETV5P41161 510 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ETV1P50549 477 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 KLHL12Q53G59 568 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 B3GLCTQ6Y288 498 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLCO6A1Q86UG4 719 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZNF441Q8N8Z8 693 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 C17orf47Q8NEP4 570 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PROKR2Q8NFJ6 384 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 RIIAD1A6NNX1 92 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ALG1L2C9J202 215 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 CCRL2O00421 344 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 RPL4P36578 427 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SOX3P41225 446 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 RPS7P62081 194 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 IGFN1Q86VF2 1251 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 BMPERQ8N8U9 685 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 OR4F15Q8NGB8 312 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 TP53INP1Q96A56 240 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 VMP1Q96GC9 406 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 TAPBPLQ9BX59 468 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SEMA4CQ9C0C4 833 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 OR51E2Q9H255 320 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLC39A1Q9NY26 324 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ICAM5Q9UMF0 924 aa13.36□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 FLRT2O43155 660 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 GP1BAP07359 652 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 PAICSP22234 425 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ACP1P24666 158 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 TACR3P29371 465 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 EVI2BP34910 448 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLC6A8P48029 635 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 TBC1D15Q8TC07 691 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 KLHDC3Q9BQ90 382 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 OR51V1Q9H2C8 321 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 MCCC2Q9HCC0 563 aa13.35□□□□□ -0.27
NICN1-201ENST00000273598 CMC2Q9NRP2 79 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms