RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 DAPL1A0PJW8 107 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 H3BSH0 61 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF217O75362 1048 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FOLR1P15328 257 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 GABRA4P48169 554 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TPTEP56180 551 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ZP2Q05996 745 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ORAI1Q96D31 301 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 A0A1B0GVT2 93 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 HMGN1P05114 100 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TPBGQ13641 420 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FHL1Q13642 323 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 DSG2Q14126 1118 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PRRG3Q9BZD7 231 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 GABRPO00591 440 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 COQ9O75208 318 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PSPHP78330 225 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 LNX2Q8N448 690 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ACBD7Q8N6N7 88 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 NMNAT3Q96T66 252 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 HPGDSO60760 199 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC25A45Q8N413 288 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 A0A087WV48 116 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CHP2O43745 196 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PTP4A3O75365 173 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SDHBP21912 280 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 MAGEB1P43366 347 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ARL4DP49703 201 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ERVK-25P63136 954 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 P2RY14Q15391 338 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RASD2Q96D21 266 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 DEPDC7Q96QD5 511 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 HPGDP15428 266 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TP53I3Q53FA7 332 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF615Q8N8J6 731 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 C4orf36Q96KX1 117 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 MMP28Q9H239 520 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CUTCQ9NTM9 273 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SDK2Q58EX2 2172 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 A0A1W2PQ09 198 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 FABP12A6NFH5 140 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 TMCC2O75069 709 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RCBTB2O95199 551 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 SHC1P29353 583 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 PYCR1P32322 319 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 OR10A3P58181 314 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.5□□□□□ -0.09
SLC20A1-201ENST00000272542 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms