RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264346.11

HERC6-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC6, Length 3,779 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6-201ENST00000264346 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
HERC6-201ENST00000264346 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
HERC6-201ENST00000264346 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC6-201ENST00000264346 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC6-201ENST00000264346 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC6-201ENST00000264346 TRIM63Q969Q1 353 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC6-201ENST00000264346 NMNAT3Q96T66 252 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC6-201ENST00000264346 FTSJ1Q9UET6 329 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC6-201ENST00000264346 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC6-201ENST00000264346 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.65□□□□□ -0.54
HERC6-201ENST00000264346 C2orf72A6NCS6 295 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ANKRD61A6NGH8 418 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 TEX46H3BTG2 121 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 NDUFB2O95178 105 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 CRYBA2P53672 197 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ACSM3Q53FZ2 586 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 NANOGP1Q8N7R0 232 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 OR4C15Q8NGM1 316 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 G6PC3Q9BUM1 346 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 BABAM2Q9NXR7 383 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ING4Q9UNL4 249 aa11.65□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 HBQ1P09105 142 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 AGAP6Q5VW22 663 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 GPAT4Q86UL3 456 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 MFSD4AQ8N468 514 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 TMEM99Q8N816 258 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ZNF511Q8NB15 262 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 BEST4Q8NFU0 473 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 TM9SF4Q92544 642 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 NR4A3Q92570 626 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ORAI1Q96D31 301 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 WDR34Q96EX3 536 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 AGAP4Q96P64 663 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 MUTYHQ9UIF7 546 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 A0A0G2JNG1 304 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 KIR2DS3K7RE56 304 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ZNF823P16415 610 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ZP2Q05996 745 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 KIR2DS5Q14953 304 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 RFT1Q96AA3 541 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 GPA33Q99795 319 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 COMMD4Q9H0A8 199 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ZNF576Q9H609 170 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 C14orf105Q9NVL8 296 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 OBP2AQ9NY56 170 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 KLRF1Q9NZS2 232 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 SERTAD3Q9UJW9 196 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 VDAC3Q9Y277 283 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 C5orf42Q9H799 3197 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 MEIOCA2RUB1 952 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 ACOD1A6NK06 481 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 K7EQS6 105 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 TP53P04637 393 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 MAPK14Q16539 360 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 BTBD16Q32M84 506 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 BCL2L15Q5TBC7 163 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 TMPRSS12Q86WS5 348 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 VWCEQ96DN2 955 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 BMFQ96LC9 184 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 KATNB1Q9BVA0 655 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 BTBD2Q9BX70 525 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 OR2B2Q9GZK3 357 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 NT5DC2Q9H857 520 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 POT1Q9NUX5 634 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 LRIT1Q9P2V4 623 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 PRODH2Q9UF12 536 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 OSGIN1Q9UJX0 560 aa11.64□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 FAM25EA8MYX2 175 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 PRAMEF2O60811 474 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 GP1BBP13224 206 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 RAB3BP20337 219 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 CD6P30203 668 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 PRKAR1BP31321 381 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 CCKBRP32239 447 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 TGFBR2P37173 567 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 FOXK2Q01167 660 aa11.63□□□□□ -0.55
HERC6-201ENST00000264346 SSX1Q16384 188 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms