RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 RPL4P36578 427 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SOX2P48431 317 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ZNF85Q03923 595 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 MLC1Q15049 377 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 FAAH2Q6GMR7 532 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TAF8Q7Z7C8 310 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 NOXA1Q86UR1 476 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 OR2L13Q8N349 312 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 GAL3ST3Q96A11 431 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 GSDMCQ9BYG8 508 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 BABAM2Q9NXR7 383 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 GNG8Q9UK08 70 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 OIP5O43482 229 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 STX11O75558 287 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 HLA-DPB1P04440 258 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD34CP0C6C1 535 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 CXCL3P19876 107 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 IFNA8P32881 189 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 IFNGR2P38484 337 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TPMTP51580 245 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 FCN2Q15485 313 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 DECR1Q16698 335 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 NKAIN2Q5VXU1 208 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TTLQ8NG68 377 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 OR52L1Q8NGH7 329 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 RNF170Q96K19 258 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ULBP3Q9BZM4 244 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ABCG5Q9H222 651 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ASB6Q9NWX5 421 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ZNF222Q9UK12 451 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 COPS3Q9UNS2 423 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SLC22A7Q9Y694 548 aa8□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TVP23AA6NH52 213 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 OR5F1O95221 314 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 CBX7O95931 251 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 PRKAR1BP31321 381 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 HTR2BP41595 481 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ABATP80404 500 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 GALK2Q01415 458 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 HYAL1Q12794 435 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 PLA2G7Q13093 441 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ASAH1Q13510 395 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 NDUFA9Q16795 377 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 NT5DC2Q9H857 520 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 BRD7Q9NPI1 651 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 HMX3A6NHT5 357 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 IFNA16P05015 189 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 FBXO45P0C2W1 286 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ATF1P18846 271 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 GIFP27352 417 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 STAT5AP42229 794 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 PSG6Q00889 435 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SQSTM1Q13501 440 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 CDK10Q15131 360 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 CBLN3Q6UW01 205 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 SLC44A3Q8N4M1 653 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ABHD4Q8TB40 342 aa7.99□□□□□ -1.13
GINS1-201ENST00000262460 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms