RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm14295A2BG91 834 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aldh3b2E9Q3E1 479 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Opn1mwO35599 359 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zp3P10761 424 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lad1P57016 528 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fezf1Q0VDQ9 475 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q3USZ8 430 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm8332Q3UTA4 144 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spag8Q3V0Q6 470 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr176Q80WT4 515 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smyd4Q8BTK5 799 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Noxo1Q8VCM2 349 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GhitmQ91VC9 346 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Thumpd1Q99J36 350 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gdpd1Q9CRY7 314 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gmeb1Q9JL60 562 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bmp10Q9R229 421 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CorinQ9Z319 1113 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ssc4dA1L0T3 586 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp993A2A8V4 313 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r3dA2AJW4 279 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn2r102L7N279 857 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pmp22P16646 161 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ucp3P56501 308 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr39Q5U431 456 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1101Q7TR59 310 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Oscp1Q8BHW2 379 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CcinQ8CDE2 588 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrpl43Q99N89 183 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gid4Q9CPY6 217 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DptQ9QZZ6 201 aa19.26■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm21149A0A0G2JFY7 255 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttc39aA2ACP1 578 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp442A2AQA0 667 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Skint4A7TZF3 474 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr592E9PYB3 312 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm7951E9Q0A2 213 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6482F6YHC1 213 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm17124F6ZIG1 213 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp994J3QM38 661 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AurkcO88445 282 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccser2Q3UHI0 833 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itgb2lQ3UV74 738 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Snx33Q4VAA7 574 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Taar7bQ5QD11 358 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Akt2Q60823 481 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PmlQ60953 885 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mfsd4aQ6PDC8 510 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Poglut1Q8BYB9 392 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dusp15Q8R4V2 235 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr658Q8VGV5 323 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NifkQ91VE6 317 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gnpda2Q9CRC9 276 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BambiQ9D0L6 260 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HhatlQ9D1G3 503 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slamf9Q9D780 285 aa19.25■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc25a34A2ADF7 318 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm572B1ARY8 399 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cldn34aG3UW52 211 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sp3O70494 783 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 OtcP11725 354 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clk1P22518 483 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gabra3P26049 492 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gna13P27601 377 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpind1P49182 478 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Glycam1Q02596 151 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dus4lQ32M08 324 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q3KQP7 184 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tfb2mQ3TL26 396 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zc3hav1Q3UPF5 946 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbxo42Q6PDJ6 717 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tha1Q6XPS7 400 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SelenoiQ80TA1 398 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm9881Q8BR56 211 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem200aQ8C817 491 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hus1bQ8K572 276 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prl8a8Q9DAS4 241 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnfrsf21Q9EPU5 655 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DiabloQ9JIQ3 237 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acss2Q9QXG4 701 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 IghdA0A0A6YW14 291 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam83cA2ARK0 776 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ChadlE9Q7T7 748 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp870J3QMA4 560 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Scarb2O35114 478 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Thbs1P35441 1170 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdh4P39038 913 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ankdd1bQ14DN9 521 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Otub1Q7TQI3 271 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cpne1Q8C166 536 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam69bQ99ML4 431 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tktl1Q99MX0 595 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acss1Q99NB1 682 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ssr2Q9CPW5 183 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc25a27Q9D6D0 322 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tnfsf14Q9QYH9 239 aa19.24■□□□□ 0.67
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TapbpQ9R233 465 aa19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.5 ms