RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	AMER3	Q8N944	861 aa		6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC126	Q96EE4	140 aa		6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	ACTL8	Q9H568	366 aa		6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	EMC7	Q9NPA0	242 aa		6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	MIOX	Q9UGB7	285 aa		6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495		V9GYH0	126 aa		6.71	□□□□□ -1.33
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC14C	A4D256	554 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC28A1	O00337	649 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SULT1C2	O00338	296 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF2	P09038	288 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP2R1B	P30154	601 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CCKBR	P32239	447 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL11	P51671	97 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFA6	Q01524	100 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNAB2	Q13303	367 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LY6D	Q14210	128 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PPA1	Q15181	289 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MICB	Q29980	383 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TMBIM1	Q969X1	311 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LHX9	Q9NQ69	397 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	OXSM	Q9NWU1	459 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SCN2A	Q99250	2005 aa		6.71	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	UPK1A	O00322	258 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SDHD	O14521	159 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC31A2	O15432	143 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FABP7	O15540	132 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	HCN1	O60741	890 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LDB3	O75112	727 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KLK1	P06870	262 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SBK3	P0C264	359 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM87A	P0C7U9	286 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PNLIP	P16233	465 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GADD45A	P24522	165 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGEA12	P43365	314 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KIR2DL3	P43628	341 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	HNMT	P50135	292 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CLDN20	P56880	219 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	GBX1	Q14549	363 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL26	Q53HC5	615 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LIPM	Q5VYY2	423 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MED27	Q6P2C8	311 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PROSER1	Q86XN7	944 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF130	Q86XS8	419 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MMP21	Q8N119	569 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CARF	Q8N187	725 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC43A2	Q8N370	569 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDT8	Q8WV74	236 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	MTERF3	Q96E29	417 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	CRB3	Q9BUF7	120 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
LETMD1-238	ENST00000623495	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		6.7	□□□□□ -1.34

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