RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 BTBD2Q9BX70 525 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 FZD7O75084 574 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 HTD2P86397 168 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 KIR2DS3Q14952 304 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SULF2Q8IWU5 870 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 OR4M1Q8NGD0 313 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 EGLN3Q9H6Z9 239 aa11.21□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 FAM227AF5H4B4 570 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 LILRB5O75023 590 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 GASTP01350 101 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SLC5A2P31639 672 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 HTR3AP46098 478 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 B3GNT2Q9NY97 397 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 ZNF225Q9UK10 706 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 HLA-DMAP28067 261 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 KCNJ8Q15842 424 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 DTD2Q96FN9 168 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 LRRC46Q96FV0 321 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SLAMF8Q9P0V8 285 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 AOAHP28039 575 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 CSNK1DP48730 415 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 CAMK2DQ13557 499 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 BATFQ16520 125 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 FAM183AA6NL82 134 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 TTLL8A6PVC2 850 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 P2RY2P41231 377 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 NOVP48745 357 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 CAV3P56539 151 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 CXADRP78310 365 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 RNF175Q8N4F7 328 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 ZNF281Q9Y2X9 895 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 NME7Q9Y5B8 376 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 A6NCN8 305 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 RCE1Q9Y256 329 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 OR52A4PA6NMU1 304 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 CTDSP2O14595 271 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 PPP3CBP16298 524 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 RAB5CP51148 216 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 WBP2NLQ6ICG8 309 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 LCN10Q6JVE6 187 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 ZNF546Q86UE3 836 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SLAMF9Q96A28 289 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SNX18Q96RF0 628 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 COPS3Q9UNS2 423 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 METTL15A6NJ78 407 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 OR2T1O43869 369 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SERPINA7P05543 415 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 CTSAP10619 480 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 TIMP2P16035 220 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 PTGER1P34995 402 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 ZNF91Q05481 1191 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 GPR18Q14330 331 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 IRF4Q15306 451 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 TXNDC15Q96J42 360 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 HRH4Q9H3N8 390 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 RAB9BQ9NP90 201 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 CBLCQ9ULV8 474 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 CA14Q9ULX7 337 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 HHLA2Q9UM44 414 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 VDAC3Q9Y277 283 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 ALS2Q96Q42 1657 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PS29 197 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 TSPAN11A1L157 253 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 ARHGAP33O14559 1287 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 SDC3O75056 442 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 ZNF217O75362 1048 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-220ENST00000611415 CD79AP11912 226 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms