RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF597Q96LX8 424 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 AGAP4Q96P64 663 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 ING2Q9H160 280 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 STMN3Q9NZ72 180 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 SELENONQ9NZV5 590 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.47□□□□□ -1.21
KDM5B-210ENST00000602511 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 A0A1B0GWA3 101 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 C7orf72A4D263 438 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 ARGFXA6NJG6 315 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 SOCS2O14508 198 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 EI24O14681 340 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 NKX2-8O15522 239 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 KLK10O43240 276 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 FRS3O43559 492 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 SCO2O43819 266 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 ADAM11O75078 769 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 DIRAS1O95057 198 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 CCNB2O95067 398 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 LYPD3O95274 346 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 P04436 131 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 GKN3PP0CG01 181 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 PRG2P13727 222 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 CBLP22681 906 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 ADH6P28332 368 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 RPS6KA3P51812 740 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 RAD23AP54725 363 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 COX10Q12887 443 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 TUBA3CQ13748 450 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 CMPK2Q5EBM0 449 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 LPCAT4Q643R3 524 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 MARCH3Q86UD3 253 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 STK32CQ86UX6 486 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 BEST3Q8N1M1 668 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 PARP8Q8N3A8 854 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 CBR4Q8N4T8 237 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 OR10G2Q8NGC3 310 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 HAS2Q92819 552 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM43Q9BTV4 400 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 ADAM19Q9H013 955 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 PTGES2Q9H7Z7 377 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 VNN3Q9NY84 501 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 GPR83Q9NYM4 423 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 RAB26Q9ULW5 256 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM5Q9Y2B1 443 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 CARD8Q9Y2G2 431 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 POFUT2Q9Y2G5 429 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 RAXQ9Y2V3 346 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 U3KQV3 271 aa7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 A0A087WUJ7 227 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 OR5H15A6NDH6 313 aa7.45□□□□□ -1.22
KDM5B-210ENST00000602511 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms