RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591265.1

ZNF554-204, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ZNF554, Length 1,148 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-204ENST00000591265 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 APOOLQ6UXV4 268 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 CHMP1BQ7LBR1 199 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 P4HA3Q7Z4N8 544 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF619Q8N2I2 560 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 PIK3IP1Q96FE7 263 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 SFXN2Q96NB2 322 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 MED18Q9BUE0 208 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 GSX2Q9BZM3 304 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 UBTD1Q9HAC8 227 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 KLHL28Q9NXS3 571 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 CAPN7Q9Y6W3 813 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 UGT2B10P36537 528 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 MVDP53602 400 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 CRISP3P54108 245 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 KLF10Q13118 480 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 FGFBP1Q14512 234 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 RGNQ15493 299 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 GTDC1Q4AE62 458 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 COX20Q5RI15 118 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 DHDDSQ86SQ9 333 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF614Q8N883 585 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 PIGQQ9BRB3 760 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 RTN4RQ9BZR6 473 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 MED11Q9P086 117 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 STOML1Q9UBI4 398 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 MKLN1Q9UL63 735 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 SERINC4A6NH21 518 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 SLC22A20A6NK97 555 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 C16orf97H3BN30 126 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 ZIC3O60481 467 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 FCMRO60667 390 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 UGT2B17O75795 530 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 H6PDO95479 791 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 NPPAP01160 153 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 BMP2P12643 396 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 PEPDP12955 493 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 ETFAP13804 333 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 POU2F1P14859 743 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 PAX1P15863 534 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 HK1P19367 917 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 SEC24CP53992 1094 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 FUT5Q11128 374 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 MMEL1Q495T6 779 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 PDZK1Q5T2W1 519 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 PERPQ96FX8 193 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 FAM107BQ9H098 131 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 VAPAQ9P0L0 249 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 TRIM64A6NGJ6 449 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 TRIM64BA6NI03 449 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 INAFM1C9JVW0 142 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 NPIPA7E9PJI5 369 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 TMCC2O75069 709 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 NPIPA8P0DM63 369 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 CD8BP10966 210 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 UBL4AP11441 157 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 ZNF17P17021 662 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 DRD4P21917 467 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 P2RX1P51575 399 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 NFYCQ13952 458 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 CD226Q15762 336 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 SYPL1Q16563 259 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 RAET1LQ5VY80 246 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 VWA1Q6PCB0 445 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF554-204ENST00000591265 DLEU7Q6UYE1 221 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms