RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587215.1

PKN1-209, Transcript of protein kinase N1, humanhuman

TSL 3

Gene PKN1, Length 363 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1-209ENST00000587215 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 SAXO2Q658L1 398 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 SLC43A2Q8N370 569 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 PSD2Q9BQI7 771 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 BCO1Q9HAY6 547 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 EXD2Q9NVH0 621 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 RAB21Q9UL25 225 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.73□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 C9JVG2 144 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ADAP00813 363 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 CSTAP01040 98 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 SLC7A1P30825 629 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 PGM1P36871 562 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 LTBQ06643 244 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 BST1Q10588 318 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 FUT5Q11128 374 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ST8SIA1Q92185 356 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 PERPQ96FX8 193 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 TEX37Q96LM6 180 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 Q96MF0 132 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 CENPHQ9H3R5 247 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ACER3Q9NUN7 267 aa14.72□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 KIAA0513O60268 411 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 CYTIPO60759 359 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 AGR2O95994 175 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 PAX1P15863 534 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 PGCP20142 388 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 EDNRAP25101 427 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 NR1H2P55055 460 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 UFM1P61960 85 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 TAB1Q15750 504 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ARL8AQ96BM9 186 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 ROPN1LQ96C74 230 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 NEURL3Q96EH8 262 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 OR5B2Q96R09 309 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 GSX2Q9BZM3 304 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 WDR45Q9Y484 360 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 DSCAMO60469 2012 aa14.71□□□□□ -0.05
PKN1-209ENST00000587215 HMGN4O00479 90 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 SDHDO14521 159 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 LY6G6DO95868 133 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 IL12AP29459 219 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 OR3A2P47893 321 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 PTH2RP49190 550 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 DIO1P49895 249 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 NME5P56597 212 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 PLAURQ03405 335 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 CHRNEQ04844 493 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 MERTKQ12866 999 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 ITGADQ13349 1161 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 P2RY6Q15077 328 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 OGFOD2Q6N063 350 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 ZNF611Q8N823 705 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 TMEM234Q8WY98 164 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 HSD17B8Q92506 261 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 COX4I2Q96KJ9 171 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 CCDC115Q96NT0 180 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 POLE3Q9NRF9 147 aa14.7□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms