RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 HSMCR30P0CW71 290 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 OR12D1P0DN82 309 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 BMP4P12644 408 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 CPEP16870 476 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 POU1F1P28069 291 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 EPHA2P29317 976 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 BCL6P41182 706 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 RABIFP47224 123 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 MTNR1AP48039 350 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 GSSP48637 474 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 BLKP51451 505 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 LIM2P55344 173 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ACTC1P68032 377 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ACTA1P68133 377 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 Q0VFX4 171 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TPBGQ13641 420 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ERV3-1Q14264 604 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 FZD2Q14332 565 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 GANABQ14697 944 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 NDUFA5Q16718 116 aa7.44□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 GPAT3Q53EU6 434 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 HACD4Q5VWC8 232 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 MZT2AQ6P582 158 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SZRD1Q7Z422 152 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 PAQR7Q86WK9 346 aa7.44□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 NUP43Q8NFH3 380 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 OR2T33Q8NG76 320 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ITFG2Q969R8 447 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 RELTQ969Z4 430 aa7.44□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 CCDC120Q96HB5 630 aa7.44□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 RLIMQ9NVW2 624 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 WDR37Q9Y2I8 494 aa7.44□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.43□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ISM1B1AKI9 464 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TBC1D3LB9A6J9 549 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 J3QRK9 145 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 ENTPD6O75354 484 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SH3BGRLO75368 114 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 STX11O75558 287 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 PTHP01270 115 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 IGF2P01344 180 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SERPIND1P05546 499 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.43□□□□□ -1.22
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GGA3-218ENST00000584243 CPN2P22792 545 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 HTR1FP30939 366 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SDC2P34741 201 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SLC9A3P48764 834 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 METAP1P53582 386 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 PPP3R1P63098 170 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 EFNB1P98172 346 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 PIGFQ07326 219 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SCN1BQ07699 218 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 CHAF1BQ13112 559 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SNAPC1Q16533 368 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SYT16Q17RD7 645 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-218ENST00000584243 SYT14P1Q58G82 188 aa7.43□□□□□ -1.22
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