RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 CCNG1P51959 295 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
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SMAD3-211ENST00000559460 FAM189A2Q15884 450 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 OR4C3Q8NH37 302 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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SMAD3-211ENST00000559460 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.36□□□□□ -1.07
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SMAD3-211ENST00000559460 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.36□□□□□ -1.07
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SMAD3-211ENST00000559460 M0R233 179 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-211ENST00000559460 PPP1R7Q15435 360 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 TAF9Q16594 264 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 PFKFB4Q16877 469 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-211ENST00000559460 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-211ENST00000559460 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-211ENST00000559460 SYNGR3O43761 229 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 CTAGE8P0CG41 777 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 TFPIP10646 304 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 MPGP29372 298 aa8.34□□□□□ -1.07
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SMAD3-211ENST00000559460 MAGEA8P43361 318 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 MTNR1AP48039 350 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 DIO1P49895 249 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 P2RX1P51575 399 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 CCR4P51679 360 aa8.34□□□□□ -1.07
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SMAD3-211ENST00000559460 RAG2P55895 527 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 LOXL3P58215 753 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 MSS51Q4VC12 460 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.34□□□□□ -1.07
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SMAD3-211ENST00000559460 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 CTAGE4Q8IX94 777 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF527Q8NB42 609 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.34□□□□□ -1.07
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