RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	FUT1	P19526	365 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCNC	P24863	283 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERAS	Q7Z444	233 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	TPRA1	Q86W33	373 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF786	Q8N393	782 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	AIG1	Q9NVV5	245 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF225	Q9UK10	706 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	USP16	Q9Y5T5	823 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A0U1RQV5	110 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A1W2PNV4	684 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLDN3	O15551	220 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	INS	P01308	110 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787		P04436	131 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	CALCB	P10092	127 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	AP3M2	P53677	418 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	MYDGF	Q969H8	173 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPA33	Q99795	319 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAL3ST1	Q99999	423 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787		A6NDX4	124 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	HIP1	O00291	1037 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	MSH4	O15457	936 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ALOX5	P09917	674 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	RSPH10B	P0C881	870 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	PGC	P20142	388 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	HTR2A	P28223	471 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRPS1	P60891	318 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	TATDN3	Q17R31	274 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	LINC01620	Q4KN68	170 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	SVOPL	Q8N434	492 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787		Q8N9W7	124 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM151A	Q8WW52	585 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM210B	Q96KR6	192 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC6A7	Q99884	636 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNF126	Q9BV68	326 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	TBK1	Q9UHD2	729 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	B9D1	Q9UPM9	204 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A087WZY1	265 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	PSMB11	A5LHX3	300 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	SDHD	O14521	159 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	NBR2	O15453	112 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	TPST2	O60704	377 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRAT	O95237	230 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	F10	P00742	488 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGF1	P05019	195 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	H2BFM	P0C1H6	154 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	POU2F1	P14859	743 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	CYP2F1	P24903	491 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	CD80	P33681	288 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	SELENOT	P62341	195 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	RIPK1	Q13546	671 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	CBLN3	Q6UW01	205 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACOT1	Q86TX2	421 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	LINC01551	Q86U37	167 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR6X1	Q8NH79	312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAPGEF5	Q92565	580 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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