RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555557.5

SRP54-208, Transcript of signal recognition particle 54, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54, Length 1,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-208ENST00000555557 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ARSKQ6UWY0 536 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 RTL4Q6ZR62 310 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 MISPQ8IVT2 679 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SPACA3Q8IXA5 215 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 WDSUB1Q8N9V3 476 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 GPR119Q8TDV5 335 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SLC39A7Q92504 469 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 NR4A3Q92570 626 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SLC38A4Q969I6 547 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 RELTQ969Z4 430 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 C3orf49Q96BT1 292 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ZNF597Q96LX8 424 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 AGAP4Q96P64 663 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 NPAS1Q99742 590 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 GPA33Q99795 319 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 DPH1Q9BZG8 443 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 DSN1Q9H410 356 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 KIF17Q9P2E2 1029 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 VDAC3Q9Y277 283 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ACACBO00763 2458 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ENO4A6NNW6 628 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 FAAHO00519 579 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 CHP2O43745 196 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 NEURL1O76050 574 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 CCNA2P20248 432 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 IGFBP5P24593 272 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SLC6A8P48029 635 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SOX8P57073 446 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 QPRTQ15274 297 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 FAHD1Q6P587 224 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ULK3Q6PHR2 472 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 RRM2BQ7LG56 351 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 NRMQ8IXM6 262 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 PFN4Q8NHR9 129 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ZNF570Q96NI8 536 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 GNRHR2Q96P88 292 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 HES7Q9BYE0 225 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 USE1Q9NZ43 259 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ABI3Q9P2A4 366 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.29□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ACACAQ13085 2346 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 P04436 131 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 THRBP10828 461 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 UQCRBP14927 111 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 PGCP20142 388 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 CBLP22681 906 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 TACR3P29371 465 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SLC1A3P43003 542 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 UGT2B15P54855 530 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 RPP38P78345 283 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SNTA1Q13424 505 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 OR1C1Q15619 314 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 TMEM239Q8WW34 195 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 GATA6Q92908 595 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 FRMD6Q96NE9 622 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 KRT84Q9NSB2 600 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 DEPPQ9NTK1 212 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.28□□□□□ -0.92
SRP54-208ENST00000555557 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms