RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 RNF6Q9Y252 685 aa14.73□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.73□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.73□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 CD8B2A6NJW9 211 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 PGCP20142 388 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 ADH6P28332 368 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 CPA2P48052 419 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 RAC1P63000 192 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 DMTNQ08495 405 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 VMACQ2NL98 169 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 LACC1Q8IV20 430 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 RND1Q92730 232 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 ZNF583Q96ND8 569 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 UCN2Q96RP3 112 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 ACER3Q9NUN7 267 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 IFT52Q9Y366 437 aa14.72□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 A0A0J9YW62 118 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 CFAP73A6NFT4 308 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 FAAHO00519 579 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 NME4O00746 187 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 DCTN3O75935 186 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 MFN2O95140 757 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 TGM6O95932 706 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 OPN1SWP03999 348 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 PRKAR1BP31321 381 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 SFTPDP35247 375 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 SLC6A8P48029 635 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 SLC7A2P52569 658 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 HOXC5Q00444 222 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 MERTKQ12866 999 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 KRT73Q86Y46 540 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 SLC15A3Q8IY34 581 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 LILRA2Q8N149 483 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 MEIOBQ8N635 442 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 FITM2Q8N6M3 262 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 FIG4Q92562 907 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 TAMM41Q96BW9 452 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 SH3GL1Q99961 368 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 PINK1Q9BXM7 581 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 CALHM2Q9HA72 323 aa14.71□□□□□ -0.05
GCN1-209ENST00000551920 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TNFSF11O14788 317 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ADAMDEC1O15204 470 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 AGAP20933 346 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ME2P23368 584 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ZNF136P52737 540 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SMSP52788 366 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SELENBP1Q13228 472 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 SMYD1Q8NB12 490 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 OR10D3Q8NH80 312 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ZNF563Q8TA94 476 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TMEM234Q8WY98 164 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 KLHL15Q96M94 604 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ECSITQ9BQ95 431 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.7□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 GP1BBP13224 206 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CD247P20963 164 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 HTR2AP28223 471 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 CHRNB4P30926 498 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 TIMP3P35625 211 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 PON3Q15166 354 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.69□□□□□ -0.06
GCN1-209ENST00000551920 XKRXQ6PP77 449 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms