RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 FNDC11Q9BVV2 318 aa18.27■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 DGCR6LQ9BY27 220 aa18.27■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 LANCL2Q9NS86 450 aa18.27■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 A0A1B0GX78 115 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 M0R3H8 397 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA0513O60268 411 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 UGT2B17O75795 530 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 DBIP07108 87 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 GGT2P36268 569 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 FUT7Q11130 342 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 MEP1AQ16819 746 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 LAIR2Q6ISS4 152 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 TTLL10Q6ZVT0 673 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 SATL1Q86VE3 508 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 VRK2Q86Y07 508 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 WFDC6Q9BQY6 131 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF160Q9HCG1 818 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 RLIMQ9NVW2 624 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 CHST2Q9Y4C5 530 aa18.26■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 SH3PXD2BA1X283 911 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 PRAMEF2O60811 474 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 IFNA8P32881 189 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 TTKP33981 857 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 EMDP50402 254 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 CDH15P55291 814 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 IL5RAQ01344 420 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 DSG2Q14126 1118 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 NPTX1Q15818 432 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 SYT16Q17RD7 645 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 CD300LDQ6UXZ3 194 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 QSOX2Q6ZRP7 698 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 COX15Q7KZN9 410 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 AQP11Q8NBQ7 271 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 OR7G1Q8NGA0 311 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 OR9Q2Q8NGE9 314 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 OR52R1Q8NGF1 315 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 FOLH1BQ9HBA9 442 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 RHCGQ9UBD6 479 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ABCA4P78363 2273 aa18.25■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC1A7O00341 560 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 WISP2O76076 250 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 BTG2P78543 158 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 COX10Q12887 443 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ZSWIM7Q19AV6 140 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 FGD3Q5JSP0 725 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 DEPDC4Q8N2C3 294 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 GPR151Q8TDV0 419 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ZG16BQ96DA0 208 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 VSTM2LQ96N03 204 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 MKLN1Q9UL63 735 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa18.24■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 VSTM2BA6NLU5 285 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ABCB7O75027 752 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ANGPTL1O95841 491 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 F10P00742 488 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 GASTP01350 101 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP4B1P13584 511 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 FOSL1P15407 271 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 IL7RP16871 459 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 GABRA3P34903 492 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC7A13Q8TCU3 470 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 OIT3Q8WWZ8 545 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 DIO2Q92813 273 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 TUBA1CQ9BQE3 449 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 RBCK1Q9BYM8 510 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 UCK2Q9BZX2 261 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF32Q9H0A6 362 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 CXorf56Q9H5V9 222 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ARMC7Q9H6L4 198 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF304Q9HCX3 659 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 CTSFQ9UBX1 484 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 TPRKBQ9Y3C4 175 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 GTF3C1Q12789 2109 aa18.23■□□□□ 0.51
CTDSP2-204ENST00000548823 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms