RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541615.5

SNHG1-218, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 5 BASIC

Gene SNHG1, Length 748 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-218	ENST00000541615	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	LRP6	O75581	1613 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	GFY	I3L273	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	MFNG	O00587	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SDHD	O14521	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	NEMP1	O14524	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	FFAR3	O14843	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	GPR42	O15529	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	IRAK2	O43187	625 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SYT7	O43581	403 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SUSD5	O60279	629 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	WDR1	O75083	606 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	FBXO24	O75426	580 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	ANXA9	O76027	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	NFATC1	O95644	943 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	NDUFB10	O96000	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	IGF2	P01344	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	C1QA	P02745	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	ALDOB	P05062	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	C8A	P07357	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CST2	P09228	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	C1S	P09871	688 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	PF4V1	P10720	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	ZNF35	P13682	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	HLA-G	P17693	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CXCL2	P19875	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SERPINA2	P20848	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SLC6A2	P23975	617 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CCKAR	P32238	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	GIPR	P48546	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	NDUFV1	P49821	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	GSK3B	P49841	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CASP7	P55210	303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CLDN18	P56856	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CDK6	Q00534	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	MYL7	Q01449	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	TCP10	Q12799	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CRHR2	Q13324	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	ENPP2	Q13822	863 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	CBFB	Q13951	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	SHH	Q15465	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	NPY5R	Q15761	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG1-218	ENST00000541615	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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