RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531933.1

ATG13-218, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 3

Gene ATG13, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-218ENST00000531933 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 SLC25A53Q5H9E4 307 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 GRINAQ7Z429 371 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PTOV1Q86YD1 416 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 LILRA2Q8N149 483 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 C10orf111Q8N326 155 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 OR2T12Q8NG77 320 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 SLC35B4Q969S0 331 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 KLHL15Q96M94 604 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 ZFP3Q96NJ6 502 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PINK1Q9BXM7 581 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PRRG4Q9BZD6 226 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PIF1Q9H611 641 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 NDE1Q9NXR1 346 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 TENM4Q6N022 2769 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 WIPF3A6NGB9 483 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 SLC22A20A6NK97 555 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 DVL2O14641 736 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 GSTA4O15217 222 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 DNAJA2O60884 412 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 CLDN14O95500 239 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 TFPIP10646 304 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 SFTPDP35247 375 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 TIMP3P35625 211 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 MAP2K6P52564 334 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 CLDN15P56746 228 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 CLDN20P56880 219 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 SESN3P58005 492 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 VEZF1Q14119 521 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 ADRM1Q16186 407 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 FAM91A1Q658Y4 838 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 HBMQ6B0K9 141 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 RTL6Q6ICC9 239 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 OR2A2Q6IF42 318 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 CADM2Q8N3J6 435 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 POC1BQ8TC44 478 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 WNT2BQ93097 391 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 LRRC46Q96FV0 321 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 RLIMQ9NVW2 624 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 SELENONQ9NZV5 590 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 RNF6Q9Y252 685 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 ZNF175Q9Y473 711 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 BSNQ9UPA5 3926 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 M0QX08 132 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 AP3D1O14617 1153 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 TNFSF11O14788 317 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 GMNNO75496 209 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 NTN1O95631 604 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 GKN3PP0CG01 181 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 CXCR1P25024 350 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 SLC1A3P43003 542 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 CPA2P48052 419 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 SLC7A2P52569 658 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PSME3P61289 254 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 PON3Q15166 354 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 C16orf89Q6UX73 402 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG13-218ENST00000531933 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms