RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523253.1

PDE7A-208, Transcript of phosphodiesterase 7A, human

TSL 4

Gene PDE7A, Length 572 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE7A-208	ENST00000523253	CSNK2B	P67870	215 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	CCNA1	P78396	465 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	ZNF45	Q02386	682 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	RAPSN	Q13702	412 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	PON2	Q15165	354 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	PARP15	Q460N3	678 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	APH1B	Q8WW43	257 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	RORB	Q92753	470 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	SLC38A4	Q969I6	547 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	RGS18	Q9NS28	235 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253		A0A075B6Q4	140 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	OR51F1	A6NGY5	319 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	SYCE1L	A8MT33	242 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253		M0R3G1	203 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	CXCR6	O00574	342 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	CXCL11	O14625	94 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	BCKDK	O14874	412 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	ANGPTL1	O95841	491 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	CST1	P01037	141 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	RNF224	P0DH78	156 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	SLC2A3	P11169	496 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	DPEP1	P16444	411 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	ITGA3	P26006	1051 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	SERPINB1	P30740	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	GCH1	P30793	250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	LHX1	P48742	406 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	CLCN4	P51793	760 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	STC1	P52823	247 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	VBP1	P61758	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	GPR50	Q13585	617 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	FUT11	Q495W5	492 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PDE7A-208	ENST00000523253	EID3	Q8N140	333 aa		4.36	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms