RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.08■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 PHF19Q5T6S3 580 aa16.08■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 DESI1Q6ICB0 168 aa16.08■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 APOOLQ6UXV4 268 aa16.08■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 SHFQ7M4L6 423 aa16.08■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 ADCK1Q86TW2 530 aa16.08■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 OPALINQ96PE5 141 aa16.08■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa16.08■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 CER1O95813 267 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 HBQ1P09105 142 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 UBL4AP11441 157 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 IL12BP29460 328 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 CCR4P51679 360 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 BMXP51813 675 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 NXNL2Q5VZ03 156 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 BBS1Q8NFJ9 593 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 NACC2Q96BF6 587 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 WWTR1Q9GZV5 400 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A087WUJ7 227 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 INHBBP09529 407 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 HOXD12P35452 270 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 SOX3P41225 446 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 SERPINB10P48595 397 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 SSX1Q16384 188 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 LPAL2Q16609 132 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 C3orf38Q5JPI3 329 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 FNDC7Q5VTL7 733 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 PLBD1Q6P4A8 553 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 CBLN3Q6UW01 205 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 LNX2Q8N448 690 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 AMER2Q8N7J2 671 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM105Q8N8V8 129 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 CENPOQ9BU64 300 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 RNF167Q9H6Y7 350 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa16.07■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 TECTAO75443 2155 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A1B0GVG6 124 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM86C2PA6NEL3 165 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF264O43296 627 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 ICOSLGO75144 302 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 HEXBP07686 556 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 ATP6V1E1P36543 226 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 TUBA1BP68363 451 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 FOXK2Q01167 660 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 RTL4Q6ZR62 310 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 USP43Q70EL4 1123 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 TUBA1AQ71U36 451 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 ATCAYQ86WG3 371 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM71CQ8NEG0 241 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 OIT3Q8WWZ8 545 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 C3orf49Q96BT1 292 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 SH3GL3Q99963 347 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 TAPBPLQ9BX59 468 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 APMAPQ9HDC9 416 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 FRYLO94915 3013 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 IDSB3KWA1 339 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 SOCS6O14544 535 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 OIP5O43482 229 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 HTR1FP30939 366 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 UGT2B10P36537 528 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 PLCXD2Q0VAA5 305 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 C19orf48Q6RUI8 117 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 OR4F15Q8NGB8 312 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 ADAMTS20P59510 1910 aa16.06■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 NOS3P29474 1203 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 SKP2Q13309 424 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 FCRLBQ6BAA4 426 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC23A3Q6PIS1 610 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 SGTBQ96EQ0 304 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 FN3KQ9H479 309 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 MED20Q9H944 212 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 WDFY4Q6ZS81 3184 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.05■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 OR6C76A6NM76 312 aa16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRN3E7EW58 273 aa16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 SYPP08247 313 aa16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 WNT4P56705 351 aa16.04■□□□□ 0.16
TSNARE1-204ENST00000519651 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms